运用磁化处理技术对工业循环冷却水进行防垢处理，其作用机理在于磁场对水及水中的离子发生作用，改变成垢晶体的结晶速度、晶粒大小、晶体结构，磁场对水系的作用是非常复杂的，有时各种作用相互加强，有时又相互抵消，其最终状态是各种机理综合作用的结果。

磁场对生物的影响是非常复杂的问题，目前的研究工作主要集中在磁场的生物效应、磁场的化学反应及交变磁场对人体的影响方面。细菌在磁场中可看成是磁偶极子，当其随水流动通过梯度磁场时，受到磁力的作用以及感应电流的作用。当感应电流达到一定的阈值(3～10A／m)时，会使细胞破坏，或改变离子通过细胞膜的途径，使蛋白质变性或破坏酶的活性。但磁场灭菌机理、细菌的生物效应和磁场的关系及各种细菌对磁场的反应等尚需做大量的工作。

使用磁化水处理器后，经过两年多的连续运行，不仅能够解决循环冷却水系统中换热设备及管网产生结垢和腐蚀的现象，而且能够降低水站稳定剂三聚磷酸钠、阻垢剂聚丙烯酸以及杀菌剂等药剂的投加量。使药剂总成本降低，供水水质满足循环冷却水水质要求。在保证换热设备的换热效率和使用年限的前提下，既降低了运行成本费用，又节约了用水，有效地减少了磷系药剂对水环境的污染。